創社初期的經濟拮据，始終未曾澆滅西田社眾人對於傳承傳統布袋戲藝術的熱情。基金會成立的前十年，除了不計成本地斥資收購具有典藏價值的珍貴戲偶，1990年8月起更投入約一百三十萬元，由臺大掌中劇團協助展開為期一年的「戲偶整理計畫」；即或因保存和修護知識的缺乏而使得整體成效有限，但總共仍整理了四百餘尊戲偶，展現基金會存續臺灣本土文化的堅定信念。
二十一世紀的到來，既伴隨科技的高度發展，更為臺灣古典布袋戲的傳承開啟一頁嶄新的篇章。事實上，當時的文建會（現為文化部）正開始大力推動數位內容產業；也即是在此「數位化」浪潮下，西田社的董事們始對社內典藏文物的收存乃至管理方式產生新的想像。不過，期間曾發生過一段插曲。自第八屆董事會起，其實投入共三年、前後花去約三百萬，陸續將存放在基金會多年的文物和文史資料進行數位化，最終卻因故未能達到預期的呈現效果。
這次挫敗經驗，或許輾轉促成西田社日後和交通大學（現為陽明交通大學）合作的契機。除了因為現任董事長陳榮祥是交大校友，基金會因而本就與交大有著較緊密的連結；交大的典藏單位於整理楊英風手稿時所展現的專業度，亦讓邱再興等西田社董事見證母校的數位化實力。2000年交大資科系楊維邦教授主持國科會「掌中乾坤——布袋戲數位博物館計畫」，旨在建置一個具有教育、展示和推廣功能的傳統掌中戲數位博物館；當時即由交大圖書館、玄奘大學和西田社合作其中一個子計畫，初步分編與數位化基金會的部分文物。約莫與此同時，總幹事楊杏枝首度將社內典藏文物的影像開放給民眾自由下載，期待能讓更多人看見臺灣傳統文化的美好。上述事件所反映的、無償地將文化資產開放給社會大眾閱覽的「資源共享」精神，相較西田社早期為了靠文物的圖像授權來賺取營運資金、從而極力保護相關影像的審慎態度，事實上已出現經營理念乃至典藏觀念上的極大轉向。
此後的十多年，基金會更逐步卸下創設初期古典掌中戲保存者和推廣者的角色，陸續將相關工作交棒給公營博物館和學術機構。如2016年，基金會先是在臺灣博物館的協助下舉辦「三十週年典藏文物特展」；又分別於2019年和2020年將收存多年的數千件文物，包含泉州戲偶和布袋戲知名藝師的影音紀錄等珍貴的有形和無形文化資產，捐贈給具有良好典藏條件的臺博館和陽明交通大學。近來科技的進步，亦使這些受贈單位得以透過數位策展或線上博物館，為當代觀眾帶來有別於傳統實體展覽的全新鑑賞體驗。值得一提的是，2021年陽明交大應用藝術所主辦的「迭袋．Iteration科技跨界展」，首次將VR（virtual reality，虛擬實境）、AR（augmented reality，擴增實境）等高互動性的新技術融入古典掌中戲的展演，足以為傳統藝術在數位時代下的傳承提供另一種思考，自有其指標。